羊驼TGF-β1基因的克隆及表达分析

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2014.06.005

畜牧兽医学报 ›› 2014, Vol. 45 ›› Issue (6): 885-892.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.06.005

羊驼TGF-β1基因的克隆及表达分析

贾小云¹，金雷皓¹，丁娜¹，罗东萍²，范瑞文³，董常生^3*

(1.山西农业大学生命科学学院，太谷 030801； 2.山西医科大学第一临床医学院风湿免疫科，太原 030001；3.山西农业大学动物科技学院，太谷 030801)

收稿日期:2013-12-27 出版日期:2014-06-23 发布日期:2014-06-23
通讯作者: 董常生，教授，博士生导师，E-mail:cs_dong@sxau.edu.cn
作者简介:贾小云（1976-），女，山西柳林人，副教授，博士，主要从事miRNA作用机理研究， E-mail：gssjxy@hotmail.com；金雷皓与贾小云为并列第一作者
基金资助:
教育部高等学校博士学科点专项科研基金（20111403120006）；中国博士后科学基金普通资助和特别资助（20100481306；2012T50246）；博士后经费（83557）；山西省留学基金（2011051）；山西人才引进与开发专项（614191）；山西省高等学校131人才；山西农业大学中青年学术骨干

Cloning and Expression of TGF-β1 Gene from Alpaca (Lama pacos)

JIA Xiao-yun¹，JIN Lei-hao¹，DING Na¹，LUO Dong-ping²，FAN Rui-wen³，DONG Chang-sheng^3*

(1.College of Life Science，Shanxi Agricultural University，Taigu 030801， China；2.The First Hospital of Shanxi Medical University，Taiyuan 030001， China；3.College of Animal Science and Veterinary Medicine，Shanxi Agricultural University，Taigu 030801， China)

Received:2013-12-27 Online:2014-06-23 Published:2014-06-23

摘要/Abstract

摘要：

旨在克隆羊驼TGF-β1基因，了解TGF-β1序列特征及其在不同组织中的表达特征，寻找TGF-β1基因的mRNA表达量与毛色之间的相关性，为研究TGF-β1基因的生物学功能提供基础。以羊驼为材料，利用3′和5′RACE技术克隆羊驼TGF-β1基因，利用DNAman、PROSITE和megAlign软件分别分析序列特征和相似性，应用荧光定量PCR （qRT-PCR）分析TGF-β1基因在不同被毛颜色羊驼皮肤组织中的表达及TGF-β1在山羊不同组织中的表达特异性。结果表明，羊驼TGF-β1 cDNA克隆全长为1 364 bp（GenBank登录号：KF887499），ORF长1 173 bp，编码390个氨基酸。氨基酸序列分析显示，羊驼TGF-β1具有其家族的典型结构特征，与其他哺乳动物相似性很高，与野猪的亲缘关系最近。羊驼TGF-β1 基因在棕色羊驼皮肤组织中的表达量是白色羊驼皮肤组织的3.5倍。组织特异性分析表明，TGF-β1在山羊不同组织中均有表达，且在淋巴组织中表达量相对最高。羊驼TGF-β1 全长cDNA的克隆和不同组织器官TGF-β1基因表达分析显示，TGF-β1与羊驼毛色形成密切相关。本研究为深入探讨TGF-β1参与动物毛色形成及调控的分子机制奠定了基础。

Abstract:

In order to explore the biological functions of TGF-β1 in coat color formation in alpaca,the experiment was conducted to clone alpaca TGF-β1 gene，investigate the expression of TGF-β1 in different tissues/organs，and examine the relationship between the TGF-β1 expression and alpaca coat color.The TGF-β1 cDNA was cloned from alpaca by 3′ and 5′ RACE.The sequence analysis was performed by DNAman，PROSITE and megAlign.The expression levels of TGF-β1 gene in different organs/tissues were analyzed by qRT-PCR.The full length of TGF-β1 cDNA in alpaca was 1 364 bp (GenBank Accession No.KF887499) with 1 173 bp ORF coding 390 amino acids.Sequence analysis showed alpaca TGF-β1 has typical structures of TGF-β1 family，showing high similarity with responsed proteins from other mammals.Phylogenetic analysis showed that alpaca TGF-β1 gene is much closed to wild boar(Sus scrofa).qRT-PCR showed that the relative gene expression level of TGF-β1 in brown alpaca was 3.5 times than that in white alpaca.TGF-β1 gene was expressed widely in tested tissues in goat while the expression levels were different in those tissues and highest in lymphoid tissue.Cloning and sequence characterization of alpaca TGF-β1 gene plus the expression analysis in different tisssues/organs indicate that TGF-β1 may play important role in alpaca coat color formation，provide the related DNA elements and experimental basic for further investigating on the molecular mechanism of TGF-β1 functions in animal coat color formation and regulation.

中图分类号:

S813.3

贾小云，金雷皓，丁娜，罗东萍，范瑞文，董常生. 羊驼TGF-β1基因的克隆及表达分析[J]. 畜牧兽医学报, 2014, 45(6): 885-892.

JIA Xiao-yun，JIN Lei-hao，DING Na，LUO Dong-ping，FAN Rui-wen，DONG Chang-sheng. Cloning and Expression of TGF-β1 Gene from Alpaca (Lama pacos)[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2014, 45(6): 885-892.

0
/ / 推荐

导出引用管理器 EndNote|Reference Manager|ProCite|BibTeX|RefWorks

链接本文: https://www.xmsyxb.com/CN/10.11843/j.issn.0366-6964.2014.06.005

https://www.xmsyxb.com/CN/Y2014/V45/I6/885

参考文献

［1］OETTING W S.The tyrosinase gene and oculocutaneous albinism type 1 (OCA1)：a model for understanding the molecular biology of melanin formation ［J］.Pigment Cell Res，2000，13：320-325.
［2］COMMO S，GAILLARD O，THIBAUT S，et al.Absence of TRP-2 in melanogenic melanocytes of human hair ［J］.Pigment Cell Res，2004，17：488-497.
［3］任玉红，任彬，范瑞文.羊驼MC1R基因克隆及其在不同毛色个体中表达水平研究［J］.畜牧兽医学报，2009，6：841-845.
［4］刘佳，董常生，范瑞文.CDK5在不同毛色羊驼皮肤中的表达分析［J］.畜牧兽医学报，2010，4：478-483.
［5］GRENSSNER A M，WEISKIRCHEN R.Modern pathogenetic concepts of liver fibrosis suggest stellate cells and TGF-β as major players and therapeutic targets ［J］.J Cell Mol Med，2006，10：76-99.
［6］WAHL S M，WEN J，MOUTSOPOULOS N.TGF-beta：a mobile purveyor of immune privilege ［J］.Immunol Rev，2006，213：213-227.
［7］LI M O，WAN Y Y，SANJABI S，et al.Transforming growth factor-beta regulation of immune responses ［J］. Annu Rev Immunol，2006，24：99-146.
［8］曾东，余文林，杨传红，等.TGF-β各亚型与其受体在猪皮肤及毛囊中的表达［J］.中国美容医学，2009，18(5)：641-643.
［9］FOITZIK K，PAUS R，DOETSCHMAN T，et al.The TGF-β2 isoform is both a required and sufficient inducer of murine hair follicle morphogenesis ［J］.Dev Biol，1999，212(2)：278-289.
［10］BARTRAM U，SPEER C P．The role of transforming growth factor beta in lung development and disease ［J］.Chest，2004，125(2)：754-765.
［11］PARK S H．Fine tuning and cross-talking of TGF-beta singal by inhibitory smads ［J］．Biochem Mol Biol，2005，38(1)：9-16.
［12］WILLERT K，NUSSE R.β-catenin：a key mediator of Wnt signaling ［J］.Curr Opin Genet Devt，1998，8(1):95-102.
［13］LARUE L，KUMASAKA M，GODING C R.β-catenin in the melanocyte lineage ［J］.Pigment Cell Res，2003，16(3):312-317.
［14］HIBINO T，NISHIYAMA T.Role of TGF-beta2 in the human hair cycle ［J］.J Dermatol Sci，2004，35(1)：9-18.
［15］BURT D W，LAW A S.Evolution of the transforming growth factor-beta superfamily ［J］.Prog Growth Factor Res，1994，5(1)：99-107.
［16］LI M O，SANJABI S，FLAVELL R A.Transforming growth factor-βcontrols development，homeostasis，and tolerance of T cells by regulatory T cell-dependent and -independent mechanisms ［J］.Immunity，2006，25(3)：455-471.
［17］TIAN X，JIANG J B，FAN R W，et al.Identification and characterization of microRNAs in white and brown alpaca skin ［J］. BMC Genomics，2012，13：555.
［18］DONG C S，WANG H D，XUE L L，et al.Coat color determination by miR-137 mediated down-regulation of microphthalmia-associated transcription factor in a mouse model ［J］. RNA，2012，18：1679-1686.
［19］ZHU Z W，HE J，JIA X，et al.MicroRNA-25 functions in regulation of pigmentation by targeting the transcription factor MITF in alpaca (Lama pacos) skin melanocytes ［J］.Domest Anim Endocrin，2010，38(3)：200-209.
［20］YI C，WANG Q，WANG L，et al.MiR-663，a microRNA targeting p21(WAF1/CIP1)，promotes the proliferation and tumorigenesis of nasopharyngeal carcinoma ［J］.Oncogene，2012，31：4421-4433.
［21］HU H Y，LI S Q，CUI X Y，et al.The overexpression of hypomethylated miR-663 induces chemotherapy resistance in human breast cancer cells by targeting heparin sulfate proteoglycan 2 (HSPG2) ［J］. J Biol Chem，2013，288(16)：10973-10985.
［22］TAO Y F，NI J，LU J，et al.The promoter of miR-663 is hypermethylated in Chinese pediatric acute myeloid leukemia (AML) ［J］.BMC Med Genet，2013，14：74.
［23］NI C W，QIU H，JO H.MicroRNA-663 upregulated by oscillatory shear stress plays a role in inflammatory response of endothelial cells ［J］.Am J Physiol-Heart C，2011，300：1762-1769.
［24］JIAN P，LI Z W，FANG T Y，et al.Retinoic acid induces HL-60 cell differentiation via the upregulation of miR-663 ［J］.J Hematol Oncol，2011，4：20.
［25］AFONYUSHKIN T，OSKOLKOVA O V，BOCHKOV V N.Permissive role of miR-663 in induction of VEGF and activation of the ATF4 branch of unfolded protein response in endothelial cells by oxidized phospholipids ［J］.Atherosclerosis，2012，225(1)：50-55.
［26］PAN J，HU H，ZHOU Z，et al.Tumor-suppressive mir-663 gene induces mitotic catastrophe growth arrest in human gastric cancer cells ［J］.Oncology Rep，2010，24(1)：105-112.

[1]	李春艳, 张彦, 吕春荣, 邓卫东, 权国波. 褪黑素的抗氧化机制及其在哺乳动物精子冷冻保存中的应用研究进展[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(11): 4468-4476.
[2]	刘爽, 贺丽霞, 马钧, 冯雪, 杨梦丽, 汪书哲, 杨润军, 房希碧, 咸海龙, 王永康, 张路培, 马云. 固原黄牛遗传背景及其体尺指数、肉用指数分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(6): 2376-2388.
[3]	杨苏坤, 董依萌, 王洪亮, 赵喜堂, 陈旭, 邢秀梅. 基于mtDNA和Y染色体基因片段的塔河马鹿种公鹿遗传多样性分析[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(6): 2402-2413.
[4]	刘铃, 王丹丹, 崔凯, 马月辉, 蒋琳. 猪繁殖与呼吸综合征抗病育种研究进展[J]. 畜牧兽医学报, 2023, 54(2): 434-442.
[5]	王宏浩, 任小康, 张毅, 高会江, 车雷杰, 王曦. 基因芯片技术在晋南牛种公牛选育中的应用[J]. 畜牧兽医学报, 2021, 52(10): 2803-2813.
[6]	刘晓倩, 靳兰杰, 董艳秋, 李冬杰, 张萃, 谷书凯, 李世杰. DNA甲基化调控牛AQP1基因的胎盘特异性印记[J]. 畜牧兽医学报, 2021, 52(8): 2181-2189.
[7]	郭潇潇, 李隐侠, 王悦, 张含, 张俊, 钱勇, 孟春花, 王慧利, 仲跻峰, 曹少先. 湖羊PLAG1基因5'调控区多态性及其与早期体重的关联分析[J]. 畜牧兽医学报, 2021, 52(2): 331-343.
[8]	郭健康, 樊自尧, 牛鹏霞, 刘志国, 牟玉莲, 张明睿, 李奎, 王冰源. Ide基因通过AKT调控成肌细胞增殖和分化的研究[J]. 畜牧兽医学报, 2020, 51(8): 1784-1794.
[9]	姚大为, 马静, 陈丽丽, 王添祯, 孙欢, 宋文芹, 马毅. 干扰PTEN基因对奶山羊乳腺上皮细胞脂质合成相关基因的转录及脂肪酸组成的影响[J]. 畜牧兽医学报, 2020, 51(4): 851-860.
[10]	崔胜, 林亚秋, 许晴, 朱江江, 王永. 干扰Smad3促进山羊脂肪细胞分化[J]. 畜牧兽医学报, 2020, 51(3): 475-489.
[11]	马静, 姚大为, 杨春蕾, 李秋玲, 王添祯, 陈成彬, 宋文芹, 马毅. 干扰CREB基因对奶山羊乳腺上皮细胞脂质合成相关基因表达及甘油三酯合成的影响[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(12): 2413-2421.
[12]	张萃, 陈玮娜, 李俊良, 谷书凯, 徐达, 李冬杰, 李世杰. LINC24065在体细胞核移植牛中的异常表达[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(1): 44-51.
[13]	王冠楠, 赵宇鹏, 陈玮娜, 张萃, 徐达, 李冬杰, 李世杰. Gab1和Sfmbt2基因在成年普通牛8种不同组织中的印记状态分析[J]. 畜牧兽医学报, 2017, 48(6): 1000-1006.
[14]	李丽莎, 彭永东, 郑晓宁, 李祥龙. 山羊PMEL基因启动子活性及转录调控元件分析[J]. 畜牧兽医学报, 2017, 48(5): 826-835.
[15]	王继英, 王彦平, 徐云华, 王诚, 蔺海朝, 呼红梅, 武英, 郭建凤. 鲁莱黑猪肌内脂肪含量、脂肪酸组成及其相关性状分析[J]. 畜牧兽医学报, 2017, 48(4): 585-594.

羊驼TGF-β1基因的克隆及表达分析

Cloning and Expression of TGF-β1 Gene from Alpaca (Lama pacos)

RichHTML

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价